Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RORAP35398 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RORAP35398 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RORAP35398 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RORAP35398 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RORAP35398 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RORAP35398 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RORAP35398 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RORAP35398 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RORAP35398 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RORAP35398 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RORAP35398 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RORAP35398 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RORAP35398 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RORAP35398 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RORAP35398 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RORAP35398 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RORAP35398 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RORAP35398 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RORAP35398 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RORAP35398 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RORAP35398 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RORAP35398 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RORAP35398 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RORAP35398 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RORAP35398 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RORAP35398 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RORAP35398 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RORAP35398 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RORAP35398 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RORAP35398 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RORAP35398 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RORAP35398 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RORAP35398 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RORAP35398 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RORAP35398 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RORAP35398 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RORAP35398 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RORAP35398 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RORAP35398 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RORAP35398 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RORAP35398 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RORAP35398 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RORAP35398 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RORAP35398 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RORAP35398 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RORAP35398 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RORAP35398 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RORAP35398 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RORAP35398 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RORAP35398 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RORAP35398 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RORAP35398 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RORAP35398 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RORAP35398 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RORAP35398 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RORAP35398 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RORAP35398 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RORAP35398 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RORAP35398 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RORAP35398 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RORAP35398 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RORAP35398 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RORAP35398 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RORAP35398 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RORAP35398 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RORAP35398 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RORAP35398 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RORAP35398 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RORAP35398 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RORAP35398 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RORAP35398 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RORAP35398 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RORAP35398 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RORAP35398 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RORAP35398 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RORAP35398 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RORAP35398 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RORAP35398 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RORAP35398 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RORAP35398 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RORAP35398 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RORAP35398 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RORAP35398 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RORAP35398 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RORAP35398 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RORAP35398 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RORAP35398 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RORAP35398 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RORAP35398 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RORAP35398 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RORAP35398 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RORAP35398 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RORAP35398 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RORAP35398 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RORAP35398 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RORAP35398 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RORAP35398 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RORAP35398 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RORAP35398 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms