Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LSP1P33241 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LSP1P33241 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LSP1P33241 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LSP1P33241 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LSP1P33241 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LSP1P33241 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LSP1P33241 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LSP1P33241 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LSP1P33241 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LSP1P33241 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LSP1P33241 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LSP1P33241 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LSP1P33241 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LSP1P33241 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
LSP1P33241 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
LSP1P33241 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LSP1P33241 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LSP1P33241 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LSP1P33241 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LSP1P33241 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LSP1P33241 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LSP1P33241 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LSP1P33241 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LSP1P33241 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LSP1P33241 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LSP1P33241 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LSP1P33241 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LSP1P33241 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LSP1P33241 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LSP1P33241 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LSP1P33241 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LSP1P33241 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LSP1P33241 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LSP1P33241 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LSP1P33241 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LSP1P33241 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LSP1P33241 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LSP1P33241 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LSP1P33241 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LSP1P33241 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LSP1P33241 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LSP1P33241 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LSP1P33241 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LSP1P33241 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LSP1P33241 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LSP1P33241 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LSP1P33241 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LSP1P33241 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LSP1P33241 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LSP1P33241 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LSP1P33241 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LSP1P33241 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LSP1P33241 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
LSP1P33241 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LSP1P33241 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LSP1P33241 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LSP1P33241 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LSP1P33241 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LSP1P33241 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LSP1P33241 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LSP1P33241 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LSP1P33241 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LSP1P33241 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LSP1P33241 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LSP1P33241 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LSP1P33241 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LSP1P33241 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LSP1P33241 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LSP1P33241 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LSP1P33241 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSP1P33241 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSP1P33241 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSP1P33241 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSP1P33241 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSP1P33241 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSP1P33241 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSP1P33241 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSP1P33241 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSP1P33241 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSP1P33241 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSP1P33241 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSP1P33241 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSP1P33241 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSP1P33241 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSP1P33241 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSP1P33241 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSP1P33241 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSP1P33241 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSP1P33241 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSP1P33241 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSP1P33241 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LSP1P33241 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSP1P33241 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSP1P33241 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LSP1P33241 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSP1P33241 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSP1P33241 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSP1P33241 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSP1P33241 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms