Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms