Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GABRB3P28472 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GABRB3P28472 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GABRB3P28472 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GABRB3P28472 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRB3P28472 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRB3P28472 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRB3P28472 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRB3P28472 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRB3P28472 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRB3P28472 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRB3P28472 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRB3P28472 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRB3P28472 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRB3P28472 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRB3P28472 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRB3P28472 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRB3P28472 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRB3P28472 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRB3P28472 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRB3P28472 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRB3P28472 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRB3P28472 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRB3P28472 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRB3P28472 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRB3P28472 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRB3P28472 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRB3P28472 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRB3P28472 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRB3P28472 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRB3P28472 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRB3P28472 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRB3P28472 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRB3P28472 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRB3P28472 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRB3P28472 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRB3P28472 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRB3P28472 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRB3P28472 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRB3P28472 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRB3P28472 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRB3P28472 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRB3P28472 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRB3P28472 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRB3P28472 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRB3P28472 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRB3P28472 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms