Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTX3P26022 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTX3P26022 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTX3P26022 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTX3P26022 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTX3P26022 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTX3P26022 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTX3P26022 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTX3P26022 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTX3P26022 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTX3P26022 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTX3P26022 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTX3P26022 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTX3P26022 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTX3P26022 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTX3P26022 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTX3P26022 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTX3P26022 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTX3P26022 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTX3P26022 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTX3P26022 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTX3P26022 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTX3P26022 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTX3P26022 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTX3P26022 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTX3P26022 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTX3P26022 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTX3P26022 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTX3P26022 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTX3P26022 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTX3P26022 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTX3P26022 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTX3P26022 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTX3P26022 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTX3P26022 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTX3P26022 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTX3P26022 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTX3P26022 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTX3P26022 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTX3P26022 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTX3P26022 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTX3P26022 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTX3P26022 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTX3P26022 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTX3P26022 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTX3P26022 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTX3P26022 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTX3P26022 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTX3P26022 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTX3P26022 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTX3P26022 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTX3P26022 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTX3P26022 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTX3P26022 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTX3P26022 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTX3P26022 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTX3P26022 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTX3P26022 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTX3P26022 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTX3P26022 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTX3P26022 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTX3P26022 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTX3P26022 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTX3P26022 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTX3P26022 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTX3P26022 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTX3P26022 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTX3P26022 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTX3P26022 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTX3P26022 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTX3P26022 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTX3P26022 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTX3P26022 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTX3P26022 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTX3P26022 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTX3P26022 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTX3P26022 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTX3P26022 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTX3P26022 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTX3P26022 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTX3P26022 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTX3P26022 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTX3P26022 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTX3P26022 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTX3P26022 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTX3P26022 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTX3P26022 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTX3P26022 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTX3P26022 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTX3P26022 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTX3P26022 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PTX3P26022 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTX3P26022 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTX3P26022 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTX3P26022 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTX3P26022 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTX3P26022 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTX3P26022 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTX3P26022 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTX3P26022 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms