Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA4P25789 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms