Protein–RNA interactions for Protein: P23921

RRM1, Ribonucleoside-diphosphate reductase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM1P23921 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRM1P23921 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRM1P23921 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRM1P23921 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRM1P23921 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRM1P23921 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRM1P23921 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRM1P23921 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRM1P23921 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRM1P23921 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRM1P23921 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRM1P23921 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRM1P23921 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRM1P23921 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRM1P23921 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRM1P23921 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRM1P23921 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRM1P23921 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRM1P23921 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRM1P23921 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRM1P23921 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRM1P23921 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRM1P23921 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRM1P23921 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRM1P23921 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRM1P23921 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRM1P23921 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRM1P23921 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRM1P23921 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRM1P23921 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRM1P23921 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRM1P23921 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRM1P23921 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRM1P23921 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRM1P23921 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRM1P23921 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRM1P23921 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RRM1P23921 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRM1P23921 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RRM1P23921 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRM1P23921 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRM1P23921 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRM1P23921 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRM1P23921 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RRM1P23921 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRM1P23921 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRM1P23921 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRM1P23921 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRM1P23921 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRM1P23921 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRM1P23921 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRM1P23921 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRM1P23921 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RRM1P23921 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRM1P23921 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRM1P23921 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRM1P23921 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRM1P23921 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRM1P23921 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRM1P23921 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RRM1P23921 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRM1P23921 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRM1P23921 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRM1P23921 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRM1P23921 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRM1P23921 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRM1P23921 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRM1P23921 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRM1P23921 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRM1P23921 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRM1P23921 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RRM1P23921 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRM1P23921 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRM1P23921 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRM1P23921 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRM1P23921 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RRM1P23921 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRM1P23921 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRM1P23921 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRM1P23921 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRM1P23921 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRM1P23921 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRM1P23921 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRM1P23921 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRM1P23921 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRM1P23921 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRM1P23921 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRM1P23921 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRM1P23921 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRM1P23921 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRM1P23921 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRM1P23921 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRM1P23921 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRM1P23921 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRM1P23921 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RRM1P23921 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRM1P23921 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRM1P23921 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRM1P23921 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRM1P23921 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms