Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDCP20941 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDCP20941 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDCP20941 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDCP20941 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PDCP20941 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDCP20941 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PDCP20941 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PDCP20941 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDCP20941 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDCP20941 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDCP20941 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDCP20941 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDCP20941 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDCP20941 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCP20941 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCP20941 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCP20941 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCP20941 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCP20941 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCP20941 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCP20941 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCP20941 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCP20941 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCP20941 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCP20941 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCP20941 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCP20941 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCP20941 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCP20941 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCP20941 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCP20941 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCP20941 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCP20941 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCP20941 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCP20941 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCP20941 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCP20941 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCP20941 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCP20941 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCP20941 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCP20941 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCP20941 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCP20941 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCP20941 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCP20941 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCP20941 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCP20941 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCP20941 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCP20941 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCP20941 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCP20941 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCP20941 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCP20941 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCP20941 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCP20941 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCP20941 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCP20941 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCP20941 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCP20941 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCP20941 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCP20941 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCP20941 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCP20941 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCP20941 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCP20941 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCP20941 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCP20941 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCP20941 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCP20941 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCP20941 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCP20941 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCP20941 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCP20941 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCP20941 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCP20941 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCP20941 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDCP20941 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDCP20941 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDCP20941 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDCP20941 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDCP20941 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDCP20941 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDCP20941 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDCP20941 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDCP20941 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDCP20941 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDCP20941 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCP20941 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCP20941 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCP20941 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCP20941 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCP20941 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCP20941 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCP20941 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCP20941 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCP20941 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCP20941 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCP20941 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCP20941 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms