Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCLP19338 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCLP19338 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCLP19338 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCLP19338 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCLP19338 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCLP19338 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCLP19338 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCLP19338 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCLP19338 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCLP19338 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NCLP19338 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCLP19338 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCLP19338 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCLP19338 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NCLP19338 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCLP19338 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCLP19338 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCLP19338 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCLP19338 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCLP19338 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCLP19338 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCLP19338 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCLP19338 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCLP19338 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCLP19338 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCLP19338 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCLP19338 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCLP19338 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCLP19338 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCLP19338 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCLP19338 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCLP19338 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCLP19338 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCLP19338 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCLP19338 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCLP19338 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCLP19338 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCLP19338 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCLP19338 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCLP19338 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCLP19338 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCLP19338 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCLP19338 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCLP19338 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCLP19338 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCLP19338 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCLP19338 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCLP19338 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCLP19338 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCLP19338 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCLP19338 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCLP19338 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NCLP19338 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NCLP19338 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCLP19338 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCLP19338 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCLP19338 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCLP19338 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCLP19338 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCLP19338 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCLP19338 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCLP19338 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCLP19338 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCLP19338 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCLP19338 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NCLP19338 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCLP19338 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NCLP19338 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NCLP19338 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCLP19338 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCLP19338 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCLP19338 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCLP19338 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCLP19338 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCLP19338 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCLP19338 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCLP19338 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCLP19338 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCLP19338 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCLP19338 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCLP19338 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCLP19338 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCLP19338 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCLP19338 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCLP19338 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCLP19338 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCLP19338 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCLP19338 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCLP19338 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCLP19338 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCLP19338 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NCLP19338 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCLP19338 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCLP19338 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCLP19338 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCLP19338 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCLP19338 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCLP19338 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCLP19338 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms