Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCP1P13796 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCP1P13796 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCP1P13796 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCP1P13796 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCP1P13796 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCP1P13796 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCP1P13796 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCP1P13796 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCP1P13796 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCP1P13796 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCP1P13796 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCP1P13796 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCP1P13796 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCP1P13796 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LCP1P13796 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCP1P13796 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCP1P13796 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCP1P13796 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCP1P13796 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCP1P13796 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCP1P13796 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCP1P13796 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCP1P13796 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LCP1P13796 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCP1P13796 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LCP1P13796 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCP1P13796 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCP1P13796 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCP1P13796 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCP1P13796 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCP1P13796 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCP1P13796 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCP1P13796 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LCP1P13796 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCP1P13796 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCP1P13796 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCP1P13796 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCP1P13796 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCP1P13796 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCP1P13796 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCP1P13796 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCP1P13796 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCP1P13796 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCP1P13796 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCP1P13796 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCP1P13796 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCP1P13796 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCP1P13796 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCP1P13796 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCP1P13796 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCP1P13796 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCP1P13796 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCP1P13796 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCP1P13796 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCP1P13796 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCP1P13796 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCP1P13796 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCP1P13796 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCP1P13796 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCP1P13796 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCP1P13796 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCP1P13796 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCP1P13796 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCP1P13796 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCP1P13796 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCP1P13796 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCP1P13796 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCP1P13796 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCP1P13796 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCP1P13796 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCP1P13796 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCP1P13796 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCP1P13796 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCP1P13796 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCP1P13796 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCP1P13796 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCP1P13796 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCP1P13796 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LCP1P13796 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCP1P13796 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LCP1P13796 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LCP1P13796 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LCP1P13796 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
LCP1P13796 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LCP1P13796 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LCP1P13796 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LCP1P13796 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LCP1P13796 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCP1P13796 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCP1P13796 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCP1P13796 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCP1P13796 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCP1P13796 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCP1P13796 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCP1P13796 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCP1P13796 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCP1P13796 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCP1P13796 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCP1P13796 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms