Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RLBP1P12271 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RLBP1P12271 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms