Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT3P12035 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT3P12035 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT3P12035 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT3P12035 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT3P12035 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT3P12035 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT3P12035 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT3P12035 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT3P12035 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT3P12035 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT3P12035 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT3P12035 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT3P12035 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT3P12035 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT3P12035 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT3P12035 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT3P12035 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT3P12035 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT3P12035 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT3P12035 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT3P12035 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT3P12035 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT3P12035 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT3P12035 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT3P12035 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT3P12035 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT3P12035 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT3P12035 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT3P12035 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT3P12035 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT3P12035 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT3P12035 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT3P12035 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT3P12035 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT3P12035 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT3P12035 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT3P12035 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT3P12035 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT3P12035 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT3P12035 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT3P12035 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT3P12035 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT3P12035 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT3P12035 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT3P12035 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT3P12035 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT3P12035 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT3P12035 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT3P12035 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT3P12035 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT3P12035 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT3P12035 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT3P12035 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT3P12035 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT3P12035 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT3P12035 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT3P12035 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT3P12035 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT3P12035 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT3P12035 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT3P12035 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT3P12035 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT3P12035 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT3P12035 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT3P12035 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT3P12035 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT3P12035 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT3P12035 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT3P12035 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT3P12035 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT3P12035 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT3P12035 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT3P12035 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT3P12035 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT3P12035 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT3P12035 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT3P12035 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT3P12035 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT3P12035 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT3P12035 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT3P12035 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT3P12035 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT3P12035 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT3P12035 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT3P12035 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT3P12035 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT3P12035 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT3P12035 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT3P12035 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT3P12035 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT3P12035 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT3P12035 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT3P12035 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT3P12035 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT3P12035 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT3P12035 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT3P12035 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT3P12035 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT3P12035 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms