Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PYGBP11216 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PYGBP11216 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PYGBP11216 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PYGBP11216 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PYGBP11216 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PYGBP11216 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PYGBP11216 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PYGBP11216 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PYGBP11216 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PYGBP11216 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PYGBP11216 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PYGBP11216 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PYGBP11216 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PYGBP11216 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PYGBP11216 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PYGBP11216 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PYGBP11216 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PYGBP11216 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PYGBP11216 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PYGBP11216 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PYGBP11216 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PYGBP11216 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PYGBP11216 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PYGBP11216 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PYGBP11216 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PYGBP11216 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PYGBP11216 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PYGBP11216 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PYGBP11216 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PYGBP11216 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PYGBP11216 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PYGBP11216 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PYGBP11216 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PYGBP11216 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PYGBP11216 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PYGBP11216 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PYGBP11216 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PYGBP11216 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PYGBP11216 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PYGBP11216 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PYGBP11216 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PYGBP11216 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PYGBP11216 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PYGBP11216 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PYGBP11216 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PYGBP11216 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PYGBP11216 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PYGBP11216 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PYGBP11216 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PYGBP11216 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PYGBP11216 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PYGBP11216 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PYGBP11216 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PYGBP11216 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PYGBP11216 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PYGBP11216 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PYGBP11216 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PYGBP11216 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PYGBP11216 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PYGBP11216 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PYGBP11216 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PYGBP11216 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PYGBP11216 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PYGBP11216 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PYGBP11216 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PYGBP11216 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PYGBP11216 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PYGBP11216 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PYGBP11216 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PYGBP11216 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PYGBP11216 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PYGBP11216 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PYGBP11216 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PYGBP11216 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PYGBP11216 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PYGBP11216 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PYGBP11216 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PYGBP11216 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PYGBP11216 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PYGBP11216 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PYGBP11216 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PYGBP11216 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PYGBP11216 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PYGBP11216 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PYGBP11216 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PYGBP11216 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PYGBP11216 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PYGBP11216 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PYGBP11216 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PYGBP11216 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PYGBP11216 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PYGBP11216 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PYGBP11216 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PYGBP11216 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PYGBP11216 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PYGBP11216 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PYGBP11216 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PYGBP11216 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PYGBP11216 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms