Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms