Protein–RNA interactions for Protein: P0C880

Putative uncharacterized protein FLJ40606, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0C880 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P0C880 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P0C880 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P0C880 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P0C880 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P0C880 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C880 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C880 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C880 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C880 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C880 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C880 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C880 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C880 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C880 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C880 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C880 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C880 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C880 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C880 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C880 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C880 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C880 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C880 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C880 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C880 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C880 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C880 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C880 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C880 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C880 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C880 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C880 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P0C880 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C880 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C880 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C880 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C880 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C880 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C880 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C880 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C880 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C880 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C880 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C880 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C880 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C880 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C880 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C880 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C880 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C880 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C880 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C880 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C880 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C880 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C880 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C880 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C880 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C880 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C880 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C880 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C880 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C880 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C880 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C880 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C880 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C880 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C880 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P0C880 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P0C880 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P0C880 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P0C880 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P0C880 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P0C880 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P0C880 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P0C880 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P0C880 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P0C880 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P0C880 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P0C880 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P0C880 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P0C880 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P0C880 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P0C880 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P0C880 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P0C880 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P0C880 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P0C880 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P0C880 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P0C880 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P0C880 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P0C880 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P0C880 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P0C880 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P0C880 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P0C880 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P0C880 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P0C880 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P0C880 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P0C880 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms