Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W0

PRR29, Proline-rich protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR29P0C7W0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRR29P0C7W0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRR29P0C7W0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRR29P0C7W0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRR29P0C7W0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRR29P0C7W0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRR29P0C7W0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRR29P0C7W0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRR29P0C7W0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRR29P0C7W0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRR29P0C7W0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRR29P0C7W0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRR29P0C7W0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms