Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
PKHD1P08F94 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms