Protein–RNA interactions for Protein: P02585

TNNC2, Troponin C, skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC2P02585 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNC2P02585 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms