Protein–RNA interactions for Protein: P01624

IGKV3-15, Immunoglobulin kappa variable 3-15, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-15P01624 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IGKV3-15P01624 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IGKV3-15P01624 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IGKV3-15P01624 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
IGKV3-15P01624 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IGKV3-15P01624 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IGKV3-15P01624 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IGKV3-15P01624 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IGKV3-15P01624 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IGKV3-15P01624 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IGKV3-15P01624 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IGKV3-15P01624 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IGKV3-15P01624 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IGKV3-15P01624 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IGKV3-15P01624 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IGKV3-15P01624 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IGKV3-15P01624 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IGKV3-15P01624 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms