Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms