Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C6orf47O95873 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C6orf47O95873 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C6orf47O95873 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms