Protein–RNA interactions for Protein: O95777

LSM8, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM8O95777 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM8O95777 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM8O95777 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM8O95777 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM8O95777 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM8O95777 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM8O95777 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM8O95777 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM8O95777 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM8O95777 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM8O95777 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM8O95777 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM8O95777 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM8O95777 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM8O95777 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM8O95777 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM8O95777 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM8O95777 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM8O95777 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM8O95777 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM8O95777 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM8O95777 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM8O95777 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM8O95777 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM8O95777 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM8O95777 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM8O95777 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM8O95777 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM8O95777 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM8O95777 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM8O95777 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM8O95777 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM8O95777 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM8O95777 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM8O95777 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM8O95777 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM8O95777 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM8O95777 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM8O95777 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM8O95777 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM8O95777 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM8O95777 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM8O95777 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM8O95777 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM8O95777 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM8O95777 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM8O95777 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM8O95777 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM8O95777 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM8O95777 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LSM8O95777 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LSM8O95777 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LSM8O95777 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSM8O95777 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSM8O95777 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSM8O95777 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSM8O95777 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSM8O95777 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSM8O95777 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSM8O95777 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSM8O95777 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSM8O95777 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM8O95777 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM8O95777 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM8O95777 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM8O95777 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM8O95777 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM8O95777 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM8O95777 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM8O95777 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM8O95777 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM8O95777 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM8O95777 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM8O95777 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM8O95777 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM8O95777 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM8O95777 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM8O95777 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM8O95777 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM8O95777 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM8O95777 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM8O95777 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM8O95777 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM8O95777 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM8O95777 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM8O95777 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM8O95777 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM8O95777 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM8O95777 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM8O95777 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM8O95777 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM8O95777 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM8O95777 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM8O95777 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM8O95777 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM8O95777 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM8O95777 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM8O95777 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM8O95777 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM8O95777 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms