Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPP2O95045 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPP2O95045 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPP2O95045 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPP2O95045 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPP2O95045 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPP2O95045 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UPP2O95045 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UPP2O95045 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UPP2O95045 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UPP2O95045 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPP2O95045 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
UPP2O95045 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPP2O95045 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPP2O95045 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
UPP2O95045 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPP2O95045 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPP2O95045 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPP2O95045 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPP2O95045 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPP2O95045 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPP2O95045 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPP2O95045 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPP2O95045 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPP2O95045 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPP2O95045 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPP2O95045 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UPP2O95045 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UPP2O95045 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPP2O95045 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPP2O95045 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPP2O95045 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPP2O95045 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPP2O95045 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPP2O95045 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPP2O95045 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPP2O95045 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPP2O95045 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
UPP2O95045 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPP2O95045 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPP2O95045 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPP2O95045 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPP2O95045 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
UPP2O95045 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPP2O95045 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPP2O95045 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPP2O95045 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPP2O95045 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPP2O95045 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPP2O95045 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPP2O95045 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPP2O95045 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPP2O95045 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPP2O95045 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPP2O95045 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPP2O95045 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
UPP2O95045 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
UPP2O95045 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
UPP2O95045 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPP2O95045 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPP2O95045 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPP2O95045 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPP2O95045 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPP2O95045 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPP2O95045 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPP2O95045 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPP2O95045 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
UPP2O95045 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPP2O95045 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPP2O95045 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPP2O95045 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPP2O95045 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPP2O95045 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPP2O95045 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
UPP2O95045 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPP2O95045 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPP2O95045 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPP2O95045 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPP2O95045 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPP2O95045 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPP2O95045 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPP2O95045 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPP2O95045 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPP2O95045 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPP2O95045 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPP2O95045 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPP2O95045 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPP2O95045 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPP2O95045 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPP2O95045 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPP2O95045 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPP2O95045 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPP2O95045 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UPP2O95045 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPP2O95045 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPP2O95045 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPP2O95045 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPP2O95045 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPP2O95045 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPP2O95045 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms