Protein–RNA interactions for Protein: O75419

CDC45, Cell division control protein 45 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC45O75419 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDC45O75419 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDC45O75419 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDC45O75419 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDC45O75419 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDC45O75419 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDC45O75419 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDC45O75419 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDC45O75419 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDC45O75419 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDC45O75419 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDC45O75419 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDC45O75419 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDC45O75419 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDC45O75419 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDC45O75419 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDC45O75419 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDC45O75419 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDC45O75419 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDC45O75419 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDC45O75419 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDC45O75419 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDC45O75419 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC45O75419 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC45O75419 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC45O75419 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC45O75419 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC45O75419 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC45O75419 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC45O75419 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC45O75419 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC45O75419 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC45O75419 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC45O75419 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC45O75419 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC45O75419 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC45O75419 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC45O75419 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC45O75419 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC45O75419 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC45O75419 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC45O75419 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC45O75419 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC45O75419 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC45O75419 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC45O75419 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC45O75419 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC45O75419 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC45O75419 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC45O75419 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDC45O75419 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDC45O75419 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDC45O75419 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDC45O75419 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDC45O75419 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDC45O75419 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDC45O75419 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDC45O75419 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDC45O75419 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDC45O75419 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC45O75419 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC45O75419 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC45O75419 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC45O75419 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC45O75419 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC45O75419 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC45O75419 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC45O75419 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC45O75419 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC45O75419 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC45O75419 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC45O75419 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC45O75419 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC45O75419 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC45O75419 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC45O75419 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC45O75419 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC45O75419 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC45O75419 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC45O75419 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC45O75419 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC45O75419 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC45O75419 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC45O75419 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC45O75419 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC45O75419 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC45O75419 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC45O75419 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC45O75419 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC45O75419 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC45O75419 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC45O75419 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC45O75419 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC45O75419 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC45O75419 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC45O75419 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC45O75419 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC45O75419 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC45O75419 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDC45O75419 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms