Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BNIP3LO60238 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms