Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms