Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBDO15205 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBDO15205 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBDO15205 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBDO15205 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBDO15205 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBDO15205 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBDO15205 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBDO15205 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBDO15205 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
UBDO15205 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBDO15205 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBDO15205 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBDO15205 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBDO15205 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBDO15205 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBDO15205 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBDO15205 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBDO15205 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBDO15205 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBDO15205 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
UBDO15205 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
UBDO15205 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBDO15205 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBDO15205 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBDO15205 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBDO15205 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBDO15205 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBDO15205 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBDO15205 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBDO15205 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBDO15205 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBDO15205 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBDO15205 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBDO15205 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBDO15205 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBDO15205 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBDO15205 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBDO15205 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
UBDO15205 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBDO15205 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBDO15205 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBDO15205 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBDO15205 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBDO15205 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBDO15205 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBDO15205 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBDO15205 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBDO15205 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBDO15205 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBDO15205 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBDO15205 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBDO15205 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBDO15205 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBDO15205 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBDO15205 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBDO15205 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBDO15205 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
UBDO15205 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBDO15205 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBDO15205 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBDO15205 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBDO15205 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBDO15205 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
UBDO15205 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBDO15205 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBDO15205 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBDO15205 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBDO15205 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBDO15205 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBDO15205 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBDO15205 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBDO15205 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBDO15205 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBDO15205 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBDO15205 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBDO15205 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBDO15205 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBDO15205 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBDO15205 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBDO15205 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBDO15205 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBDO15205 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBDO15205 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBDO15205 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBDO15205 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBDO15205 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBDO15205 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBDO15205 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBDO15205 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBDO15205 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBDO15205 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBDO15205 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBDO15205 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBDO15205 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBDO15205 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBDO15205 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBDO15205 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBDO15205 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBDO15205 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms