Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP290O15078 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP290O15078 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP290O15078 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP290O15078 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP290O15078 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP290O15078 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP290O15078 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP290O15078 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP290O15078 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CEP290O15078 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CEP290O15078 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CEP290O15078 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CEP290O15078 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP290O15078 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP290O15078 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP290O15078 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP290O15078 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP290O15078 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP290O15078 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP290O15078 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP290O15078 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP290O15078 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP290O15078 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP290O15078 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP290O15078 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP290O15078 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP290O15078 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP290O15078 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP290O15078 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP290O15078 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP290O15078 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP290O15078 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP290O15078 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP290O15078 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP290O15078 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP290O15078 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP290O15078 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP290O15078 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP290O15078 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP290O15078 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP290O15078 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP290O15078 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP290O15078 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP290O15078 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP290O15078 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP290O15078 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP290O15078 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP290O15078 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP290O15078 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP290O15078 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP290O15078 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP290O15078 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP290O15078 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP290O15078 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP290O15078 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP290O15078 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP290O15078 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP290O15078 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP290O15078 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP290O15078 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP290O15078 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP290O15078 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP290O15078 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP290O15078 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP290O15078 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP290O15078 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP290O15078 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP290O15078 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP290O15078 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP290O15078 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP290O15078 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP290O15078 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP290O15078 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP290O15078 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP290O15078 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP290O15078 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP290O15078 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP290O15078 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP290O15078 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP290O15078 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP290O15078 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP290O15078 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP290O15078 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP290O15078 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP290O15078 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP290O15078 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP290O15078 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CEP290O15078 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP290O15078 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP290O15078 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP290O15078 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP290O15078 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP290O15078 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP290O15078 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP290O15078 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP290O15078 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP290O15078 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP290O15078 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP290O15078 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
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