Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms