Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PODXLO00592 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PODXLO00592 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PODXLO00592 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PODXLO00592 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PODXLO00592 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PODXLO00592 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PODXLO00592 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PODXLO00592 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PODXLO00592 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PODXLO00592 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PODXLO00592 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PODXLO00592 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PODXLO00592 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PODXLO00592 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PODXLO00592 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PODXLO00592 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PODXLO00592 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PODXLO00592 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PODXLO00592 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PODXLO00592 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PODXLO00592 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PODXLO00592 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PODXLO00592 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PODXLO00592 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PODXLO00592 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PODXLO00592 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PODXLO00592 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PODXLO00592 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PODXLO00592 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PODXLO00592 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PODXLO00592 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PODXLO00592 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PODXLO00592 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PODXLO00592 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PODXLO00592 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PODXLO00592 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PODXLO00592 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PODXLO00592 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PODXLO00592 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PODXLO00592 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PODXLO00592 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PODXLO00592 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PODXLO00592 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PODXLO00592 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PODXLO00592 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PODXLO00592 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PODXLO00592 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PODXLO00592 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PODXLO00592 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PODXLO00592 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PODXLO00592 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PODXLO00592 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PODXLO00592 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PODXLO00592 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PODXLO00592 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PODXLO00592 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PODXLO00592 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PODXLO00592 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PODXLO00592 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PODXLO00592 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PODXLO00592 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PODXLO00592 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PODXLO00592 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PODXLO00592 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PODXLO00592 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PODXLO00592 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PODXLO00592 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PODXLO00592 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PODXLO00592 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PODXLO00592 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PODXLO00592 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PODXLO00592 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PODXLO00592 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PODXLO00592 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PODXLO00592 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PODXLO00592 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PODXLO00592 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PODXLO00592 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PODXLO00592 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PODXLO00592 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PODXLO00592 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PODXLO00592 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PODXLO00592 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PODXLO00592 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PODXLO00592 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PODXLO00592 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PODXLO00592 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PODXLO00592 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PODXLO00592 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PODXLO00592 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PODXLO00592 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXLO00592 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXLO00592 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXLO00592 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXLO00592 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXLO00592 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXLO00592 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXLO00592 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXLO00592 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms