Protein–RNA interactions for Protein: O00264

PGRMC1, Membrane-associated progesterone receptor component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRMC1O00264 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PGRMC1O00264 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGRMC1O00264 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGRMC1O00264 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGRMC1O00264 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGRMC1O00264 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGRMC1O00264 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGRMC1O00264 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGRMC1O00264 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PGRMC1O00264 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGRMC1O00264 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGRMC1O00264 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGRMC1O00264 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGRMC1O00264 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGRMC1O00264 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGRMC1O00264 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGRMC1O00264 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGRMC1O00264 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGRMC1O00264 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGRMC1O00264 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGRMC1O00264 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGRMC1O00264 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGRMC1O00264 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGRMC1O00264 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGRMC1O00264 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGRMC1O00264 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGRMC1O00264 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGRMC1O00264 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGRMC1O00264 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGRMC1O00264 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGRMC1O00264 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGRMC1O00264 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGRMC1O00264 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGRMC1O00264 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGRMC1O00264 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGRMC1O00264 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGRMC1O00264 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGRMC1O00264 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGRMC1O00264 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGRMC1O00264 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGRMC1O00264 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGRMC1O00264 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGRMC1O00264 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGRMC1O00264 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGRMC1O00264 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms