Protein–RNA interactions for Protein: O00203

AP3B1, AP-3 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B1O00203 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP3B1O00203 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3B1O00203 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3B1O00203 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3B1O00203 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3B1O00203 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3B1O00203 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3B1O00203 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3B1O00203 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3B1O00203 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3B1O00203 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3B1O00203 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3B1O00203 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3B1O00203 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3B1O00203 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3B1O00203 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3B1O00203 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3B1O00203 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3B1O00203 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3B1O00203 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3B1O00203 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3B1O00203 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3B1O00203 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3B1O00203 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3B1O00203 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3B1O00203 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3B1O00203 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3B1O00203 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3B1O00203 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3B1O00203 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3B1O00203 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3B1O00203 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3B1O00203 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3B1O00203 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3B1O00203 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3B1O00203 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3B1O00203 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3B1O00203 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3B1O00203 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3B1O00203 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3B1O00203 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3B1O00203 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms