Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2K7ER74 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms