Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
J3KR12 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
J3KR12 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3KR12 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3KR12 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3KR12 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3KR12 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3KR12 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3KR12 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3KR12 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
J3KR12 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
J3KR12 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
J3KR12 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
J3KR12 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
J3KR12 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
J3KR12 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
J3KR12 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
J3KR12 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
J3KR12 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
J3KR12 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
J3KR12 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
J3KR12 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
J3KR12 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
J3KR12 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
J3KR12 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
J3KR12 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3KR12 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3KR12 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3KR12 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3KR12 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3KR12 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3KR12 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3KR12 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3KR12 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3KR12 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3KR12 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
J3KR12 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3KR12 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3KR12 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3KR12 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3KR12 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
J3KR12 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
J3KR12 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
J3KR12 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
J3KR12 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
J3KR12 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
J3KR12 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
J3KR12 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
J3KR12 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
J3KR12 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
J3KR12 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
J3KR12 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
J3KR12 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
J3KR12 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
J3KR12 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
J3KR12 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
J3KR12 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
J3KR12 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
J3KR12 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
J3KR12 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
J3KR12 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
J3KR12 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
J3KR12 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
J3KR12 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
J3KR12 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
J3KR12 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
J3KR12 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
J3KR12 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
J3KR12 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
J3KR12 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
J3KR12 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
J3KR12 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
J3KR12 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
J3KR12 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
J3KR12 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
J3KR12 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
J3KR12 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
J3KR12 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
J3KR12 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
J3KR12 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
J3KR12 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
J3KR12 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
J3KR12 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
J3KR12 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
J3KR12 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
J3KR12 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
J3KR12 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3KR12 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3KR12 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3KR12 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3KR12 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3KR12 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3KR12 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3KR12 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3KR12 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3KR12 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3KR12 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3KR12 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3KR12 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3KR12 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms