Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCER2I3L3R5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms