Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H3BQV1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
H3BQV1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H3BQV1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H3BQV1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H3BQV1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
H3BQV1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
H3BQV1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
H3BQV1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H3BQV1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H3BQV1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H3BQV1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
H3BQV1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
H3BQV1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
H3BQV1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H3BQV1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
H3BQV1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H3BQV1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H3BQV1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BQV1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BQV1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BQV1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BQV1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BQV1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BQV1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BQV1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BQV1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BQV1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BQV1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BQV1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BQV1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BQV1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BQV1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BQV1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BQV1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BQV1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
H3BQV1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
H3BQV1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
H3BQV1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
H3BQV1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
H3BQV1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
H3BQV1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
H3BQV1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
H3BQV1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
H3BQV1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
H3BQV1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
H3BQV1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
H3BQV1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
H3BQV1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
H3BQV1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
H3BQV1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H3BQV1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H3BQV1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
H3BQV1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
H3BQV1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H3BQV1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H3BQV1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
H3BQV1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
H3BQV1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H3BQV1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
H3BQV1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H3BQV1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H3BQV1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H3BQV1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
H3BQV1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
H3BQV1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H3BQV1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H3BQV1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
H3BQV1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
H3BQV1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
H3BQV1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H3BQV1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H3BQV1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H3BQV1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BQV1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BQV1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BQV1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BQV1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BQV1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BQV1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BQV1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BQV1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BQV1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BQV1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BQV1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BQV1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BQV1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BQV1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BQV1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BQV1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BQV1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H3BQV1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H3BQV1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H3BQV1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
H3BQV1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H3BQV1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H3BQV1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
H3BQV1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
H3BQV1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
H3BQV1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms