Protein–RNA interactions for Protein: H3BQF6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQF6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H3BQF6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
H3BQF6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H3BQF6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H3BQF6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3BQF6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3BQF6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3BQF6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3BQF6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3BQF6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3BQF6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3BQF6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3BQF6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3BQF6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3BQF6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3BQF6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3BQF6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3BQF6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3BQF6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3BQF6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3BQF6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3BQF6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3BQF6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3BQF6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3BQF6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3BQF6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3BQF6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3BQF6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3BQF6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3BQF6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3BQF6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3BQF6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3BQF6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3BQF6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3BQF6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
H3BQF6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3BQF6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3BQF6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3BQF6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3BQF6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3BQF6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3BQF6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3BQF6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3BQF6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3BQF6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3BQF6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3BQF6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H3BQF6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H3BQF6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H3BQF6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H3BQF6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
H3BQF6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H3BQF6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H3BQF6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H3BQF6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H3BQF6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H3BQF6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H3BQF6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H3BQF6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H3BQF6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
H3BQF6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H3BQF6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H3BQF6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H3BQF6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H3BQF6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
H3BQF6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
H3BQF6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
H3BQF6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H3BQF6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H3BQF6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
H3BQF6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
H3BQF6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H3BQF6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
H3BQF6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H3BQF6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
H3BQF6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H3BQF6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H3BQF6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
H3BQF6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
H3BQF6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
H3BQF6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
H3BQF6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H3BQF6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H3BQF6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
H3BQF6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H3BQF6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H3BQF6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H3BQF6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H3BQF6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H3BQF6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
H3BQF6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
H3BQF6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
H3BQF6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
H3BQF6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
H3BQF6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
H3BQF6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H3BQF6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
H3BQF6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H3BQF6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H3BQF6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms