Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms