Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF879B4DU55 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF879B4DU55 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms