Protein–RNA interactions for Protein: A8K830

COLCA2, Colorectal cancer-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLCA2A8K830 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms