Protein–RNA interactions for Protein: A6NIK2

LRRC10B, Leucine-rich repeat-containing protein 10B, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC10BA6NIK2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms