Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA6L4A6NEF3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA6L4A6NEF3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms