Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VWA3AA6NCI4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VWA3AA6NCI4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms