Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms