Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LCHNA4D1U4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms