Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POTEB3A0JP26 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POTEB3A0JP26 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POTEB3A0JP26 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POTEB3A0JP26 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POTEB3A0JP26 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POTEB3A0JP26 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POTEB3A0JP26 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POTEB3A0JP26 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POTEB3A0JP26 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POTEB3A0JP26 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POTEB3A0JP26 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POTEB3A0JP26 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POTEB3A0JP26 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POTEB3A0JP26 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POTEB3A0JP26 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POTEB3A0JP26 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POTEB3A0JP26 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
POTEB3A0JP26 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
POTEB3A0JP26 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
POTEB3A0JP26 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
POTEB3A0JP26 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POTEB3A0JP26 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms