Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 SNHG15-208ENST00000584327 505 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 AL136115.2-201ENST00000602889 587 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 AC091905.3-201ENST00000624959 234 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 AL139035.1-202ENST00000626308 565 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 AL160408.6-201ENST00000632063 1257 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 AL137785.1-201ENST00000637466 490 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 ANKRD34B-201ENST00000338682 3938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 TM2D3-202ENST00000347970 1329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 MMS19-201ENST00000327238 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 TBL1XR1-214ENST00000457928 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 GOLGA6L5P-201ENST00000414190 2337 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 GATD1-201ENST00000319863 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 POLDIP3-201ENST00000252115 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 SLC36A2-204ENST00000521967 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 ATP2A1-201ENST00000357084 3532 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 PIK3CD-207ENST00000543390 3503 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 CALML4-204ENST00000448060 2520 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 OGDHL-202ENST00000419399 3588 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 TKTL1-201ENST00000369912 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 OSBPL7-201ENST00000007414 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 IL4R-202ENST00000395762 3685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 AL713998.1-201ENST00000412872 1605 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 SLC25A19-201ENST00000320362 1651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 CCDC36-203ENST00000438782 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 AC004264.2-201ENST00000623328 1737 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 CYP17A1-206ENST00000638971 1722 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 ZNF423-201ENST00000262383 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 NRG1-203ENST00000405005 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 ATG16L1-203ENST00000392017 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 AL592287.1-201ENST00000637598 2074 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 ELMSAN1-204ENST00000423556 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 AL138916.2-201ENST00000606686 2144 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 LRP1-202ENST00000338962 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 NUTM2A-AS1-205ENST00000420424 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 ABCB9-204ENST00000392439 3791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 AC048338.1-201ENST00000535844 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 ZSCAN22-201ENST00000329665 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 TIGIT-201ENST00000383671 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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LMO3Q8TAP4 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 CANT1-216ENST00000620915 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 ANAPC16-205ENST00000621663 3567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 TMIGD1-201ENST00000328886 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 AC079987.1-201ENST00000420181 123 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 RPL10P12-201ENST00000427342 318 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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LMO3Q8TAP4 AC079385.2-201ENST00000547531 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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LMO3Q8TAP4 SEC14L3-203ENST00000402286 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 ATP7B-203ENST00000400366 6304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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LMO3Q8TAP4 LINC00857-201ENST00000422847 2161 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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LMO3Q8TAP4 AP3B2-203ENST00000535359 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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LMO3Q8TAP4 BIRC2-201ENST00000227758 3743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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LMO3Q8TAP4 IGHMBP2-201ENST00000255078 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 WDR62-201ENST00000270301 4632 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 ALDH3A2-202ENST00000339618 3828 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 PPP2R5C-203ENST00000350249 3845 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 PAQR7-201ENST00000374296 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 DLG1-215ENST00000448528 2977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 CDRT4-204ENST00000619038 2498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 ZNF133-214ENST00000628216 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 MPP7-202ENST00000375719 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 LINC00538-201ENST00000626109 1906 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 EIF4BP8-201ENST00000464704 1826 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 SRD5A3-AS1-201ENST00000433175 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 ZBTB8OS-208ENST00000468695 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 NCR1-205ENST00000594765 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 ZNF200-209ENST00000575948 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 FCRLA-203ENST00000309691 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 CD8B-202ENST00000349455 849 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LMO3Q8TAP4 CA5BP1-203ENST00000380334 1264 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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