Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A4Q9Y6R1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms