Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U5

TNFRSF18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF18Q9Y5U5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF18Q9Y5U5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms