Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
GTF3C3Q9Y5Q9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GTF3C3Q9Y5Q9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms